Grippe ou Covid, quels tests pour trancher ?

Grippe ou Covid-19 ? Alors que la question risque de se poser de plus en plus souvent dans les semaines qui viennent, la HAS vient de publier un avis qui précise les indications des tests combinés SARS-CoV-2/virus respiratoires.

Comme le rappelle en préambule le document, l’identification précise d’une infection virale saisonnière en association avec une recherche du SARS-CoV-2 n’est utile que chez les patients symptomatiques, lorsqu’elle impacte les mesures d’isolement à mettre en œuvre ou qu’elle permet d’optimiser la prise en charge diagnostique (orientation ou limitation des examens complémentaires) ou thérapeutique (juste prescription des antibiotiques notamment).

Dans ce contexte, la réalisation de tests combinés ne se justifie que chez « les adultes (symptomatiques) hospitalisés ou arrivant aux urgences, les résidents en Ehpad et les jeunes enfants », résume la HAS. Chez les autres personnes, il n'est pas nécessaire de vouloir identifier le virus, la prise en charge étant symptomatique et repose sur l'évolution de la maladie, « seul un test de détection du SARS-CoV-2 est alors indiqué ».

Éviter le recours aux antibiotiques

En ville, la question se pose en population pédiatrique, notamment pour éviter le recours inutile aux antibiotiques. « Chez les enfants, les pathologies respiratoires ont des manifestations moins franches que chez les adultes mais leurs conséquences peuvent être graves et souvent, un traitement antibiotique probabiliste est initié, considère la HAS. Aussi, la réalisation d'un test est utile chez les enfants présentant une infection respiratoire, quel que soit le lieu de soins pour initier une prise en charge adaptée et éviter les traitements inutiles. » Si, à l’hôpital, « tous les virus respiratoires suspectés sont recherchés par l'équipe médicale par tests RT-PCR, avec une attention particulière à porter au VRS) », en ville, seule la recherche du SARS-CoV-2 et des virus grippaux par test antigénique est préconisée.

« Les recherches directes des virus grippaux ne doivent avoir lieu qu'au cours de la période épidémique de grippe saisonnière », rappelle la HAS. Le recours aux différents tests est indépendant du statut vaccinal. Il est possible de faire plusieurs tests unitaires en parallèle ou d'utiliser un test « multiplex », qui permet de détecter simultanément plusieurs pathogènes à partir d'un même prélèvement et avec la même technique d'amplification génique habituellement de type PCR.